Removed remove_short_loops functionality.
[libdai.git] / ChangeLog
index 4afe39a..00460a0 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,13 +1,18 @@
 libDAI-0.2.2 (2008-??-??)
 -------------------------
 
+* Now compiles also under Visual C++.
+* Added Exceptions framework.
+* Replaced ENUM2,ENUM3,ENUM4,ENUM5,ENUM6 by single DAI_ENUM macro.
+* Removed utils/remove_short_loops and matlab/remove_short_loops.
+* Added more features to utils/createfg for creating factor graphs.
 * Pervasive change of BipartiteGraph implementation (based on an idea by
-  Giuseppe Passino). BipartiteGraph no longer stores the node properties (former
-  _V1 and _V2), nor does it store a dense adjacency matrix anymore, nor an edge
-  list. Instead, it stores the graph structure as lists of neighboring nodes.
-  This yields a significant memory/speed improvement for large factor graphs, and
-  is more elegant as well. Iterating over neighbors is made easy by using
-  boost::foreach.
+  Giuseppe Passino). BipartiteGraph no longer stores the node properties 
+  (former _V1 and _V2), nor does it store a dense adjacency matrix anymore, 
+  nor an edge list. Instead, it stores the graph structure as lists of 
+  neighboring nodes. This yields a significant memory/speed improvement for 
+  large factor graphs, and is more elegant as well. Iterating over neighbors is
+  made easy by using boost::foreach.
 * Improved index.h (merged from SVN head):
   - Renamed Index -> IndexFor
   - Added some .reserve()'s to IndexFor methods which yields a 
@@ -26,11 +31,11 @@ libDAI-0.2.2 (2008-??-??)
   - changed #ifndefs to GNU style
   - added extra warning checks (-W -Wextra) and fixed resulting warnings
   - dai::TProb: 
-    o  removed copy constructor and assignment operators (redundant)
-    o  implementation of some methods via STL algorithms
-    o  added methods takeExp, takeLog, takeLog0 for transformation in-place
-    o  explicit constructor (prevents implicit conversion from size_t to TProb)
-    o  added operator+,+=,-,-=, with argument T (for calculations in log-scale)
+    o removed copy constructor and assignment operators (redundant)
+    o implementation of some methods via STL algorithms
+    o added methods takeExp, takeLog, takeLog0 for transformation in-place
+    o explicit constructor (prevents implicit conversion from size_t to TProb)
+    o added operator+,+=,-,-=, with argument T (for calculations in log-scale)
   - Added "logdomain" property to BP, a boolean that controls whether 
     calculations are done in the log-domain or in the linear domain;
     doing calculations in the log-domain may help if the numerical range
@@ -42,27 +47,56 @@ libDAI-0.2.2 (2008-??-??)
 * FactorGraph constructors no longer check for short loops (huge speed
   increase for large factor graphs), nor for negative entries. Also, the 
   normtype is now Prob::NORMPROB by default.
+* VarSet is now implemented using a std::vector<Var> instead of a
+  std::set<Var>, which yields a significant speed improvement.
+* Improved MaxSpanningTreePrims algorithm (uses boost::graph)
 * Small optimization in Diffs
+* Replaced Complex with real numbers (negative potentials is just not
+  used enough to warrant the additional "complexity" :))
+* Moved Properties and MaxDiff frameworks from InfAlg to each individual
+  inference algorithm, because the Properties framework was not as 
+  convenient as I hoped, and not every inference algorithm needs a maxdiff
+  variable. Also, replaced some FactorGraph functionality in InfAlg by a
+  function that returns the FactorGraph. The result is cleaner (less 
+  entangled) code.
+* Improved ClusterGraph implementation, yielding significant speedups
+  for the JunctionTree algorithm on large factorgraphs.
+* Improved documetation
 * Interface changes:
   - VarSet::
-    stateSpace() -> VarSet::states()
+      stateSpace() -> states()
+      VarSet( const std::set<Var> ) -> VarSet( begin, end, sizeHint=0 )
+      VarSet( const std::vector<Var> ) -> VarSet( begin, end, sizeHint=0 )
+      removed bool operator||
+      operator&&(const VarSet&) -> intersects(const VarSet&)
+      operator&&(const Var&) -> contains(const Var&)
   - FactorGraph::
-    delta(const Var &) -> delta(size_t)
-    Delta(const Var &) -> Delta(size_t)
-    makeCavity(const Var &) -> makeCavity(size_t)
-    removed MakeFactorCavity(size_t)
-    removed ExactMarginal(const VarSet &)
-    removed ExactlogZ()
-    moved isConnected() to BipartiteGraph
-    vars() -> vars
-    factors() -> factors
+      delta(const Var &) -> delta(size_t)
+      Delta(const Var &) -> Delta(size_t)
+      makeCavity(const Var &) -> makeCavity(size_t)
+      vars() -> vars
+      factors() -> factors
+      removed MakeFactorCavity(size_t)
+      removed ExactMarginal(const VarSet &)
+      removed ExactlogZ()
+      moved isConnected() to BipartiteGraph
+      removed updatedFactor(size_t)
+      removed _normtype and NormType()
   - RegionGraph::
-    nr_ORs() -> nrORs()
-    nr_IRs() -> nrIRs()
-    ORs() -> ORs
-    IRs() -> IRs
+      nr_ORs() -> nrORs()
+      nr_IRs() -> nrIRs()
+      ORs() -> ORs
+      IRs() -> IRs
   - *::Regenerate() -> *::create()
   - Renamed Index -> IndexFor
+  - Diffs:
+      max() -> maxDiff()
+      max_size() -> maxSize()
+  - Prob::max() -> Prob::maxVal()
+  - Factor::max() -> Factor::maxVal()
+  - toc() in util.h now returns seconds as a double
+  - VarSet::operator&&
+  - Properties -> PropertySet
 
 
 libDAI-0.2.1 (2008-05-26)