Improved mf.h/cpp by adding "init" and "updates" options
[libdai.git] / Makefile.LINUX
index 657b39f..e5bf70c 100644 (file)
@@ -4,38 +4,17 @@
 # 2, or (at your option) any later version. libDAI is distributed without any
 # warranty. See the file COPYING for more details.
 #
-# Copyright (C) 2009  Joris Mooij  [joris dot mooij at libdai dot org]
+# It has been tested with Ubuntu 8.04, Ubuntu 9.04 and Debian testing
+#
+# Copyright (C) 2009-2010  Joris Mooij  [joris dot mooij at libdai dot org]
 
 
-# This template contains configurations for compiling libDAI under GNU/Linux and other UNIX variants
+# This template contains configurations for compiling libDAI under GNU/Linux
+# and other UNIX variants
 #
 # To use it, simply copy this file to 'Makefile.conf' and adapt 'Makefile.conf'
 # to your local setup
-#
-# A boolean variable VAR can be set to true ("VAR=true") or to false ("VAR=")
-
 
-# COMPILATION AND BUILD FLAGS
-# Enable/disable various approximate inference methods
-WITH_BP=true
-WITH_FBP=true
-WITH_TRWBP=true
-WITH_MF=true
-WITH_HAK=true
-WITH_LC=true
-WITH_TREEEP=true
-WITH_JTREE=true
-WITH_MR=true
-WITH_GIBBS=true
-WITH_CBP=true
-# Build doxygen documentation?
-WITH_DOC=true
-# Build with debug info?
-DEBUG=true
-# Build matlab interface?
-WITH_MATLAB=
-# MatLab version 7.3 (R2006b) or newer?
-NEW_MATLAB=true
 
 # OPERATING SYSTEM
 # Choose OS from {LINUX, WINDOWS, CYGWIN, MACOSX}
@@ -68,8 +47,9 @@ CCINC=-Iinclude
 # LINKER
 # Standard libraries to include
 LIBS=-ldai
-# For linking with the BOOST Program Options library
-BOOSTLIBS=-lboost_program_options-mt
+# For linking with BOOST libraries
+BOOSTLIBS_PO=-lboost_program_options-mt
+BOOSTLIBS_UTF=-lboost_unit_test_framework-mt
 # Additional library search paths for linker
 CCLIB=-Llib
 
@@ -78,8 +58,13 @@ CCLIB=-Llib
 MATLABDIR=/agbs/share/sw/matlab
 # The following should resolve to the MatLab mex compile command
 MEX=$(MATLABDIR)/bin/mex
-# Specify the same C++ compiler and flags to mex
-MEXFLAGS=CXX\#$(CC) CXXFLAGS\#'$(CCFLAGS)'
+# Specify the C++ compiler and flags for MEX
+# (MatLab R2008b only works with older versions of g++)
+MEXFLAGS:=CXX\#g++-4.1 CXXFLAGS\#'$(CCFLAGS)'
+# Standard include directories for MEX
+MEXINC:=$(CCINC)
+# Additional library search paths for MEX
+MEXLIB=
 
 # SWIG PYTHON INTERFACE
 # The following should resolve to the SWIG command