Improved documentation of include/dai/jtree.h and did some cleanups
[libdai.git] / Makefile
index 85b32dd..7ff3579 100644 (file)
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -103,7 +103,7 @@ MEX:=$(MEX) $(CCLIB) $(CCINC) $(MEXFLAGS)
 
 all : $(TARGETS)
 
 
 all : $(TARGETS)
 
-examples : examples/example$(EE) examples/example_bipgraph$(EE) examples/example_varset$(EE) examples/example_sprinkler$(EE)
+examples : examples/example$(EE) examples/example_bipgraph$(EE) examples/example_varset$(EE) examples/example_permute$(EE) examples/example_sprinkler$(EE)
 
 matlabs : matlab/dai$(ME) matlab/dai_readfg$(ME) matlab/dai_writefg$(ME) matlab/dai_potstrength$(ME)
 
 
 matlabs : matlab/dai$(ME) matlab/dai_readfg$(ME) matlab/dai_writefg$(ME) matlab/dai_potstrength$(ME)
 
@@ -202,6 +202,9 @@ examples/example_bipgraph$(EE) : examples/example_bipgraph.cpp $(HEADERS) $(LIB)
 examples/example_varset$(EE) : examples/example_varset.cpp $(HEADERS) $(LIB)/libdai$(LE)
        $(CC) $(CCO)examples/example_varset$(EE) examples/example_varset.cpp $(LIBS)
 
 examples/example_varset$(EE) : examples/example_varset.cpp $(HEADERS) $(LIB)/libdai$(LE)
        $(CC) $(CCO)examples/example_varset$(EE) examples/example_varset.cpp $(LIBS)
 
+examples/example_permute$(EE) : examples/example_permute.cpp $(HEADERS) $(LIB)/libdai$(LE)
+       $(CC) $(CCO)examples/example_permute$(EE) examples/example_permute.cpp $(LIBS)
+
 examples/example_sprinkler$(EE) : examples/example_sprinkler.cpp $(HEADERS) $(LIB)/libdai$(LE)
        $(CC) $(CCO)examples/example_sprinkler$(EE) examples/example_sprinkler.cpp $(LIBS)
 
 examples/example_sprinkler$(EE) : examples/example_sprinkler.cpp $(HEADERS) $(LIB)/libdai$(LE)
        $(CC) $(CCO)examples/example_sprinkler$(EE) examples/example_sprinkler.cpp $(LIBS)
 
@@ -303,7 +306,7 @@ ifneq ($(OS),WINDOWS)
 clean :
        -rm *$(OE)
        -rm matlab/*$(ME)
 clean :
        -rm *$(OE)
        -rm matlab/*$(ME)
-       -rm examples/example$(EE) examples/example_bipgraph$(EE) examples/example_varset$(EE) examples/example_sprinkler$(EE)
+       -rm examples/example$(EE) examples/example_bipgraph$(EE) examples/example_varset$(EE) examples/example_permute$(EE) examples/example_sprinkler$(EE)
        -rm tests/testdai$(EE) tests/testem/testem$(EE) tests/testbbp$(EE)
        -rm utils/fg2dot$(EE) utils/createfg$(EE) utils/fginfo$(EE)
        -rm -R doc
        -rm tests/testdai$(EE) tests/testem/testem$(EE) tests/testbbp$(EE)
        -rm utils/fg2dot$(EE) utils/createfg$(EE) utils/fginfo$(EE)
        -rm -R doc