Merge branch 'master' into gibbs
[libdai.git] / doxygen.conf
index febd3e1..83f9a31 100644 (file)
@@ -99,7 +99,7 @@ ALWAYS_DETAILED_SEC    = NO
 # members were ordinary class members. Constructors, destructors and assignment 
 # operators of the base classes will not be shown.
 
-INLINE_INHERITED_MEMB  = NO
+INLINE_INHERITED_MEMB  = YES
 
 # If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then Doxygen will prepend the full 
 # path before files name in the file list and in the header files. If set 
@@ -186,7 +186,7 @@ TAB_SIZE               = 8
 # will result in a user-defined paragraph with heading "Side Effects:". 
 # You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines.
 
-ALIASES                = 
+ALIASES                = "idea=\xrefitem ideas \"Idea\" \"Ideas worth exploring\""
 
 # Set the OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C tag to YES if your project consists of C 
 # sources only. Doxygen will then generate output that is more tailored for C. 
@@ -268,7 +268,7 @@ TYPEDEF_HIDES_STRUCT   = NO
 # Private class members and static file members will be hidden unless 
 # the EXTRACT_PRIVATE and EXTRACT_STATIC tags are set to YES
 
-EXTRACT_ALL            = YES
+EXTRACT_ALL            = NO
 
 # If the EXTRACT_PRIVATE tag is set to YES all private members of a class 
 # will be included in the documentation.
@@ -278,7 +278,7 @@ EXTRACT_PRIVATE        = NO
 # If the EXTRACT_STATIC tag is set to YES all static members of a file 
 # will be included in the documentation.
 
-EXTRACT_STATIC         = NO
+EXTRACT_STATIC         = YES
 
 # If the EXTRACT_LOCAL_CLASSES tag is set to YES classes (and structs) 
 # defined locally in source files will be included in the documentation. 
@@ -513,8 +513,7 @@ WARN_LOGFILE           =
 # directories like "/usr/src/myproject". Separate the files or directories 
 # with spaces.
 
-INPUT                  = src \
-                         include/dai
+INPUT                  = src include/dai
 
 # This tag can be used to specify the character encoding of the source files 
 # that doxygen parses. Internally doxygen uses the UTF-8 encoding, which is 
@@ -537,7 +536,7 @@ FILE_PATTERNS          =
 # should be searched for input files as well. Possible values are YES and NO. 
 # If left blank NO is used.
 
-RECURSIVE              = NO
+RECURSIVE              = YES
 
 # The EXCLUDE tag can be used to specify files and/or directories that should 
 # excluded from the INPUT source files. This way you can easily exclude a 
@@ -571,7 +570,7 @@ EXCLUDE_SYMBOLS        =
 # directories that contain example code fragments that are included (see 
 # the \include command).
 
-EXAMPLE_PATH           = 
+EXAMPLE_PATH           = examples
 
 # If the value of the EXAMPLE_PATH tag contains directories, you can use the 
 # EXAMPLE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
@@ -1116,7 +1115,7 @@ INCLUDE_FILE_PATTERNS  =
 # undefined via #undef or recursively expanded use the := operator 
 # instead of the = operator.
 
-PREDEFINED             = 
+PREDEFINED             = DAI_WITH_BP DAI_WITH_MF DAI_WITH_HAK DAI_WITH_LC DAI_WITH_TREEEP DAI_WITH_JTREE DAI_WITH_MR
 
 # If the MACRO_EXPANSION and EXPAND_ONLY_PREDEF tags are set to YES then 
 # this tag can be used to specify a list of macro names that should be expanded.