Updated copyrights
[libdai.git] / example.cpp
index 5bada87..47c83f3 100644 (file)
@@ -1,28 +1,30 @@
-/*  Copyright 2006-2008  Joris Mooij
-    jorism@jorismooij.nl
-    
-    This file is part of AI.
+/*  Copyright (C) 2006-2008  Joris Mooij  [joris dot mooij at tuebingen dot mpg dot de]
+    Radboud University Nijmegen, The Netherlands /
+    Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Germany
 
-    AI is free software; you can redistribute it and/or modify
+    This file is part of libDAI.
+
+    libDAI is free software; you can redistribute it and/or modify
     it under the terms of the GNU General Public License as published by
     the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
     (at your option) any later version.
 
-    AI is distributed in the hope that it will be useful,
+    libDAI is distributed in the hope that it will be useful,
     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
     GNU General Public License for more details.
 
     You should have received a copy of the GNU General Public License
-    along with AI; if not, write to the Free Software
+    along with libDAI; if not, write to the Free Software
     Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
 */
 
 
 #include <iostream>
-#include "alldai.h"
+#include <dai/alldai.h>
 
 
+using namespace dai;
 using namespace std;
 
 
@@ -34,36 +36,43 @@ int main( int argc, char *argv[] ) {
         return 1;
     } else {
         FactorGraph fg;
+        fg.ReadFromFile(argv[1]);
+
+        size_t  maxiter = 10000;
+        double  tol = 1e-9;
+        size_t  verb = 1;
+
+        PropertySet opts;
+        opts.Set("maxiter",maxiter);
+        opts.Set("tol",tol);
+        opts.Set("verbose",verb);
+
+        JTree jt( fg, opts("updates",string("HUGIN")) );
+        jt.init();
+        jt.run();
+
+        BP bp(fg, opts("updates",string("SEQFIX"))("logdomain",false));
+        bp.init();
+        bp.run();
+
+        cout << "Exact single node marginals:" << endl;
+        for( size_t i = 0; i < fg.nrVars(); i++ )
+            cout << jt.belief(fg.var(i)) << endl;
+
+        cout << "Approximate (loopy belief propagation) single node marginals:" << endl;
+        for( size_t i = 0; i < fg.nrVars(); i++ )
+            cout << bp.belief(fg.var(i)) << endl;
+
+        cout << "Exact factor marginals:" << endl;
+        for( size_t I = 0; I < fg.nrFactors(); I++ )
+            cout << jt.belief(fg.factor(I).vars()) << endl;
+
+        cout << "Approximate (loopy belief propagation) factor marginals:" << endl;
+        for( size_t I = 0; I < fg.nrFactors(); I++ )
+            cout << bp.belief(fg.factor(I).vars()) << "=" << bp.beliefF(I) << endl;
 
-        if( fg.ReadFromFile(argv[1]) ) {
-            cout << "Error reading " << argv[1] << endl;
-            return 2;
-        } else {
-            size_t  maxiter = 1000;
-            double  tol = 1e-9;
-            size_t  verb = 1;
-
-            Properties opts;
-            opts.Set("maxiter",maxiter);
-            opts.Set("tol",tol);
-            opts.Set("verbose",verb);
-
-            JTree jt( fg, opts("updates",string("HUGIN")) );
-            jt.init();
-            jt.run();
-
-            cout << "Exact single node marginals:" << endl;
-            for( size_t i = 0; i < fg.nrVars(); i++ )
-                cout << jt.belief(fg.var(i)) << endl;
-
-            BP bp(fg, opts("updates",string("SEQMAX")));
-            bp.init();
-            bp.run();
-
-            cout << "Exact single node marginals:" << endl;
-            for( size_t i = 0; i < fg.nrVars(); i++ )
-                cout << bp.belief(fg.var(i)) << endl;
-        }
+        cout << "Exact log partition sum: " << jt.logZ() << endl;
+        cout << "Approximate (loopy belief propagation) log partition sum: " << bp.logZ() << endl;
     }
 
     return 0;