Added DAG class and various minor improvements
[libdai.git] / include / dai / bipgraph.h
index 47aa8e3..4dbd543 100644 (file)
@@ -155,10 +155,11 @@ class BipartiteGraph {
          *  \param nrNodes2 The number of nodes of type 2.
          *  \param begin Points to the first edge.
          *  \param end Points just beyond the last edge.
+         *  \param check Whether to only add an edge if it does not exist already.
          */
         template<typename EdgeInputIterator>
-        BipartiteGraph( size_t nrNodes1, size_t nrNodes2, EdgeInputIterator begin, EdgeInputIterator end ) : _nb1(), _nb2() {
-            construct( nrNodes1, nrNodes2, begin, end );
+        BipartiteGraph( size_t nrNodes1, size_t nrNodes2, EdgeInputIterator begin, EdgeInputIterator end, bool check=true ) : _nb1(), _nb2() {
+            construct( nrNodes1, nrNodes2, begin, end, check );
         }
     //@}
 
@@ -221,9 +222,10 @@ class BipartiteGraph {
          *  \param nrNodes2 The number of nodes of type 2.
          *  \param begin Points to the first edge.
          *  \param end Points just beyond the last edge.
+         *  \param check Whether to only add an edge if it does not exist already.
          */
         template<typename EdgeInputIterator>
-        void construct( size_t nrNodes1, size_t nrNodes2, EdgeInputIterator begin, EdgeInputIterator end );
+        void construct( size_t nrNodes1, size_t nrNodes2, EdgeInputIterator begin, EdgeInputIterator end, bool check=true );
 
         /// Adds a node of type 1 without neighbors and returns the index of the added node.
         size_t addNode1() { _nb1.push_back( Neighbors() ); return _nb1.size() - 1; }
@@ -281,7 +283,7 @@ class BipartiteGraph {
         /// Adds an edge between node \a n1 of type 1 and node \a n2 of type 2.
         /** If \a check == \c true, only adds the edge if it does not exist already.
          */
-        void addEdge( size_t n1, size_t n2, bool check = true );
+        BipartiteGraph& addEdge( size_t n1, size_t n2, bool check = true );
     //@}
 
     /// \name Erasing nodes and edges
@@ -351,6 +353,12 @@ class BipartiteGraph {
             return nb2(n2).size();
         }
 
+        /// Returns neighbors of node \a n1 of type 1 as a SmallSet<size_t>.
+        SmallSet<size_t> nb1Set( size_t n1 ) const;
+
+        /// Returns neighbors of node \a n2 of type 2 as a SmallSet<size_t>.
+        SmallSet<size_t> nb2Set( size_t n2 ) const;
+
         /// Calculates second-order neighbors (i.e., neighbors of neighbors) of node \a n1 of type 1.
         /** If \a include == \c true, includes \a n1 itself, otherwise excludes \a n1.
          *  \note In libDAI versions 0.2.4 and earlier, this function used to return a std::vector<size_t>
@@ -372,7 +380,7 @@ class BipartiteGraph {
         /// Comparison operator which returns true if two graphs are identical
         /** \note Two graphs are called identical if they have the same number of nodes
          *  of both types and the same edges (i.e., \a x has an edge between nodes
-         *  n1 and n2 if and only if \c *this has an edge between nodes n1 and n2).
+         *  \a n1 and \a n2 if and only if \c *this has an edge between nodes \a n1 and \a n2).
          */
         bool operator==( const BipartiteGraph& x ) const {
             if( nrNodes1() != x.nrNodes1() )
@@ -400,24 +408,25 @@ class BipartiteGraph {
     //@{
         /// Writes this BipartiteGraph to an output stream in GraphViz .dot syntax
         void printDot( std::ostream& os ) const;
+
+        /// Writes this BipartiteGraph to an output stream
+        friend std::ostream& operator<<( std::ostream& os, const BipartiteGraph& g ) {
+            g.printDot( os );
+            return os;
+        }
     //@}
 };
 
 
 template<typename EdgeInputIterator>
-void BipartiteGraph::construct( size_t nrNodes1, size_t nrNodes2, EdgeInputIterator begin, EdgeInputIterator end ) {
+void BipartiteGraph::construct( size_t nrNodes1, size_t nrNodes2, EdgeInputIterator begin, EdgeInputIterator end, bool check ) {
     _nb1.clear();
     _nb1.resize( nrNodes1 );
     _nb2.clear();
     _nb2.resize( nrNodes2 );
 
-    for( EdgeInputIterator e = begin; e != end; e++ ) {
-#ifdef DAI_DEBUG
-        addEdge( e->first, e->second, true );
-#else
-        addEdge( e->first, e->second, false );
-#endif
-    }
+    for( EdgeInputIterator e = begin; e != end; e++ )
+        addEdge( e->first, e->second, check );
 }