Removed obsolete/deprecated stuff
[libdai.git] / include / dai / varset.h
index f0df85f..361ef7f 100644 (file)
@@ -11,7 +11,7 @@
 
 
 /// \file
-/// \brief Defines VarSet class
+/// \brief Defines the VarSet class, which represents a set of random variables.
 
 
 #ifndef __defined_libdai_varset_h
 namespace dai {
 
 
+// Predefine for definitions of calcLinearState() and calcState()
+class VarSet;
+
+
+/// Calculates the linear index in the Cartesian product of the variables in \a vs that corresponds to a particular joint assignment of the variables, specified by \a state.
+/** \param vs Set of variables for which the linear state should be calculated;
+ *  \param state Specifies the states of some variables.
+ *  \return The linear index in the Cartesian product of the variables in \a vs
+ *  corresponding with the joint assignment specified by \a state, where variables
+ *  for which no state is specified are assumed to be in state 0.
+ *
+ *  The linear index is calculated as follows. The variables in \a vs are
+ *  ordered according to their label (in ascending order); say \a vs corresponds with
+ *  the set \f$\{x_{l(0)},x_{l(1)},\dots,x_{l(n-1)}\}\f$ with \f$l(0) < l(1) < \dots < l(n-1)\f$,
+ *  where variable \f$x_l\f$ has label \a l. Denote by \f$S_l\f$ the number of possible values
+ *  ("states") of variable \f$x_l\f$. The argument \a state corresponds
+ *  with a mapping \a s that assigns to each variable \f$x_l\f$ a state \f$s(x_l) \in \{0,1,\dots,S_l-1\}\f$,
+ *  where \f$s(x_l)=0\f$ if \f$x_l\f$ is not specified in \a state. The linear index \f$S\f$ corresponding
+ *  with \a state is now calculated by:
+ *  \f{eqnarray*}
+ *    S &:=& \sum_{i=0}^{n-1} s(x_{l(i)}) \prod_{j=0}^{i-1} S_{l(j)} \\
+ *      &= & s(x_{l(0)}) + s(x_{l(1)}) S_{l(0)} + s(x_{l(2)}) S_{l(0)} S_{l(1)} + \dots + s(x_{l(n-1)}) S_{l(0)} \cdots S_{l(n-2)}.
+ *  \f}
+ *
+ *  \note If \a vs corresponds with \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$, and \a state specifies a state
+ *  for each variable \f$x_l\f$ for \f$l\in L\f$, calcLinearState() induces a mapping
+ *  \f$\sigma : \prod_{l\in L} X_l \to \{0,1,\dots,\prod_{l\in L} S_l-1\}\f$ that
+ *  maps a joint state to a linear index; this is the inverse of the mapping
+ *  \f$\sigma^{-1}\f$ induced by calcState().
+ *
+ *  \see calcState()
+ */
+size_t calcLinearState( const VarSet &vs, const std::map<Var, size_t> &state );
+
+
+/// Calculates the joint assignment of the variables in \a vs corresponding to the linear index \a linearState.
+/** \param vs Set of variables to which \a linearState refers
+ *  \param linearState should be smaller than vs.nrStates().
+ *  \return A mapping \f$s\f$ that maps each Var \f$x_l\f$ in \a vs to its state \f$s(x_l)\f$, as specified by \a linearState.
+ *
+ *  The variables in \a vs are ordered according to their label (in ascending order); say \a vs corresponds with
+ *  the set \f$\{x_{l(0)},x_{l(1)},\dots,x_{l(n-1)}\}\f$ with \f$l(0) < l(1) < \dots < l(n-1)\f$,
+ *  where variable \f$x_l\f$ has label \a l. Denote by \f$S_l\f$ the number of possible values
+ *  ("states") of variable \f$x_l\f$ with label \a l.
+ *  The mapping \f$s\f$ returned by this function is defined as:
+ *  \f{eqnarray*}
+ *    s(x_{l(i)}) = \left\lfloor\frac{S \mbox { mod } \prod_{j=0}^{i} S_{l(j)}}{\prod_{j=0}^{i-1} S_{l(j)}}\right\rfloor \qquad \mbox{for all $i=0,\dots,n-1$}.
+ *  \f}
+ *  where \f$S\f$ denotes the value of \a linearState.
+ *
+ *  \note If \a vs corresponds with \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$, calcState() induces a mapping
+ *  \f$\sigma^{-1} : \{0,1,\dots,\prod_{l\in L} S_l-1\} \to \prod_{l\in L} X_l\f$ that
+ *  maps a linear index to a joint state; this is the inverse of the mapping \f$\sigma\f$
+ *  induced by calcLinearState().
+ *
+ *  \see calcLinearState()
+ */
+std::map<Var, size_t> calcState( const VarSet &vs, size_t linearState );
+
+
 /// Represents a set of variables.
 /** \note A VarSet is implemented using a SmallSet<Var> instead
  *  of the more natural std::set<Var> because of efficiency reasons.
- *  That is, internally, the variables in the set are sorted according
- *  to their labels: the set of variables \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$ is
- *  represented as a vector \f$(x_{l(0)},x_{l(1)},\dots,x_{l(|L|-1)})\f$
- *  where \f$l(0) < l(1) < \dots < l(|L|-1)\f$
- *  and \f$L = \{l(0),l(1),\dots,l(|L|-1)\}\f$.
+ *  That is, internally, the variables in the set are sorted ascendingly
+ *  according to their labels.
  */
 class VarSet : public SmallSet<Var> {
     public:
-        /// Default constructor
+    /// \name Constructors and destructors
+    //@{
+        /// Default constructor (constructs an empty set)
         VarSet() : SmallSet<Var>() {}
 
-        /// Construct from SmallSet<Var>
+        /// Construct from \link SmallSet \endlink<\link Var \endlink> \a x
         VarSet( const SmallSet<Var> &x ) : SmallSet<Var>(x) {}
 
-        /// Calculates the number of states of this VarSet.
-        /** The number of states of the Cartesian product of the variables in this VarSet
-         *  is simply the product of the number of states of each variable in this VarSet.
-         *  If *this corresponds with the set \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$,
-         *  where variable \f$x_l\f$ has label \f$l\f$, and denoting by \f$S_l\f$ the
-         *  number of possible values ("states") of variable \f$x_l\f$, the number of
-         *  joint configurations of the variables in \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$ is given by \f$\prod_{l\in L} S_l\f$.
-         */
-        size_t nrStates() {
-            size_t states = 1;
-            for( VarSet::const_iterator n = begin(); n != end(); n++ )
-                states *= n->states();
-            return states;
-        }
-
-        /// Construct a VarSet with one element
-        VarSet( const Var &n ) : SmallSet<Var>(n) {}
+        /// Construct a VarSet with one element, \a v
+        VarSet( const Var &v ) : SmallSet<Var>(v) {}
 
-        /// Construct a VarSet with two elements
-        VarSet( const Var &n1, const Var &n2 ) : SmallSet<Var>(n1,n2) {}
+        /// Construct a VarSet with two elements, \a v1 and \a v2
+        VarSet( const Var &v1, const Var &v2 ) : SmallSet<Var>(v1,v2) {}
 
-        /// Construct a VarSet from a range.
+        /// Construct a VarSet from the range between \a begin and \a end.
         /** \tparam VarIterator Iterates over instances of type Var.
          *  \param begin Points to first Var to be added.
          *  \param end Points just beyond last Var to be added.
-         *  \param sizeHint For efficiency, the number of elements can be speficied by sizeHint.
+         *  \param sizeHint For efficiency, the number of elements can be speficied by \a sizeHint.
          */
         template <typename VarIterator>
         VarSet( VarIterator begin, VarIterator end, size_t sizeHint=0 ) : SmallSet<Var>(begin,end,sizeHint) {}
+    //@}
 
-        /// Calculates the linear index in the Cartesian product of the variables in *this, which corresponds to a particular joint assignment of the variables specified by \a states.
-        /** \param states Specifies the states of some variables.
-         *  \return The linear index in the Cartesian product of the variables in *this
-         *  corresponding with the joint assignment specified by \a states, where it is
-         *  assumed that \a states[\a m]==0 for all \a m in *this which are not in \a states.
-         *
-         *  The linear index is calculated as follows. The variables in *this are
-         *  ordered according to their label (in ascending order); say *this corresponds with
-         *  the set \f$\{x_{l(0)},x_{l(1)},\dots,x_{l(n-1)}\}\f$ with \f$l(0) < l(1) < \dots < l(n-1)\f$,
-         *  where variable \f$x_l\f$ has label \a l. Denote by \f$S_l\f$ the number of possible values
-         *  ("states") of variable \f$x_l\f$. The argument \a states corresponds
-         *  with a mapping \a s that assigns to each variable \f$x_l\f$ a state \f$s(x_l) \in \{0,1,\dots,S_l-1\}\f$,
-         *  where \f$s(x_l)=0\f$ if \f$x_l\f$ is not specified in \a states. The linear index \a S corresponding
-         *  with \a states is now calculated as:
-         *  \f{eqnarray*}
-         *    S &:=& \sum_{i=0}^{n-1} s(x_{l(i)}) \prod_{j=0}^{i-1} S_{l(j)} \\
-         *      &= & s(x_{l(0)}) + s(x_{l(1)}) S_{l(0)} + s(x_{l(2)}) S_{l(0)} S_{l(1)} + \dots + s(x_{l(n-1)}) S_{l(0)} \cdots S_{l(n-2)}.
-         *  \f}
-         *
-         *  \note If *this corresponds with \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$, and \a states specifies a state
-         *  for each variable \f$x_l\f$ for \f$l\in L\f$, calcState(const std::map<Var,size_t> &) induces a mapping
-         *  \f$\sigma : \prod_{l\in L} X_l \to \{0,1,\dots,\prod_{l\in L} S_l-1\}\f$ that
-         *  maps a joint state to a linear index; this is the inverse of the mapping
-         *  \f$\sigma^{-1}\f$ induced by calcStates(size_t).
-         */
-        size_t calcState( const std::map<Var, size_t> &states ) {
-            size_t prod = 1;
-            size_t state = 0;
-            for( VarSet::const_iterator n = begin(); n != end(); n++ ) {
-                std::map<Var, size_t>::const_iterator m = states.find( *n );
-                if( m != states.end() )
-                    state += prod * m->second;
-                prod *= n->states();
-            }
-            return state;
-        }
-
-        /// Calculates the joint assignment of the variables in *this corresponding to the linear index \a linearState.
-        /** \param linearState should be smaller than nrStates().
-         *  \return A mapping \f$s\f$ that maps each Var \f$x_l\f$ in *this to its state \f$s(x_l)\f$, as specified by \a linearState.
-         *
-         *  The variables in *this are ordered according to their label (in ascending order); say *this corresponds with
-         *  the set \f$\{x_{l(0)},x_{l(1)},\dots,x_{l(n-1)}\}\f$ with \f$l(0) < l(1) < \dots < l(n-1)\f$,
-         *  where variable \f$x_l\f$ has label \a l. Denote by \f$S_l\f$ the number of possible values
-         *  ("states") of variable \f$x_l\f$ with label \a l.
-         *  The mapping \a s returned by this function is defined as:
-         *  \f{eqnarray*}
-         *    s(x_{l(i)}) = \left\lfloor\frac{S \mbox { mod } \prod_{j=0}^{i} S_{l(j)}}{\prod_{j=0}^{i-1} S_{l(j)}}\right\rfloor \qquad \mbox{for all $i=0,\dots,n-1$}.
-         *  \f}
-         *  where \f$S\f$ denotes the value of \a linearState.
-         *
-         *  \note If *this corresponds with \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$, calcStates(size_t) induces a mapping
-         *  \f$\sigma^{-1} : \{0,1,\dots,\prod_{l\in L} S_l-1\} \to \prod_{l\in L} X_l\f$ that
-         *  maps a linear index to a joint state; this is the inverse of the mapping \f$\sigma\f$
-         *  induced by calcState(const std::map<Var,size_t> &).
+    /// \name Queries
+    //@{
+        /// Calculates the number of states of this VarSet, which is simply the number of possible joint states of the variables in \c *this.
+        /** The number of states of the Cartesian product of the variables in this VarSet
+         *  is simply the product of the number of states of each variable in this VarSet.
+         *  If \c *this corresponds with the set \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$,
+         *  where variable \f$x_l\f$ has label \f$l\f$, and denoting by \f$S_l\f$ the
+         *  number of possible values ("states") of variable \f$x_l\f$, the number of
+         *  joint configurations of the variables in \f$\{x_l\}_{l\in L}\f$ is given by \f$\prod_{l\in L} S_l\f$.
          */
-        std::map<Var, size_t> calcStates( size_t linearState ) {
-            std::map<Var, size_t> states;
-            for( VarSet::const_iterator n = begin(); n != end(); n++ ) {
-                states[*n] = linearState % n->states();
-                linearState /= n->states();
-            }
-            DAI_ASSERT( linearState == 0 );
+        size_t nrStates() const {
+            size_t states = 1;
+            for( VarSet::const_iterator n = begin(); n != end(); n++ )
+                states *= n->states();
             return states;
         }
+    //@}
 
+    /// \name Input and output
+    //@{
         /// Writes a VarSet to an output stream
-        friend std::ostream& operator<< (std::ostream &os, const VarSet& ns)  {
+        friend std::ostream& operator<<( std::ostream &os, const VarSet &vs )  {
             os << "{";
-            for( VarSet::const_iterator n = ns.begin(); n != ns.end(); n++ )
-                os << (n != ns.begin() ? "," : "") << *n;
+            for( VarSet::const_iterator v = vs.begin(); v != vs.end(); v++ )
+                os << (v != vs.begin() ? ", " : "") << *v;
             os << "}";
             return( os );
         }
+    //@}
 };
 
 
@@ -157,7 +157,7 @@ class VarSet : public SmallSet<Var> {
 
 
 /** \example example_varset.cpp
- *  This example shows how to use the Var and VarSet classes. It also explains the concept of "states" for VarSets.
+ *  This example shows how to use the Var, VarSet and State classes. It also explains the concept of "states" for VarSets.
  *
  *  \section Output
  *  \verbinclude examples/example_varset.out