Fixed bug in BP (introduced in commit b8f96214...) and added regression test for...
[libdai.git] / tests / testem / testem.cpp
index cfa172a..05b6e2e 100644 (file)
@@ -1,3 +1,14 @@
+/*  This file is part of libDAI - http://www.libdai.org/
+ *
+ *  libDAI is licensed under the terms of the GNU General Public License version
+ *  2, or (at your option) any later version. libDAI is distributed without any
+ *  warranty. See the file COPYING for more details.
+ *
+ *  Copyright (C) 2009  Charles Vaske  [cvaske at soe dot ucsc dot edu]
+ *  Copyright (C) 2009  University of California Santa Cruz
+ */
+
+
 #include <iostream>
 #include <fstream>
 #include <string>
@@ -11,7 +22,7 @@ using namespace std;
 using namespace dai;
 
 
-void usage( const stringmsg ) {
+void usage( const string &msg ) {
     cerr << msg << endl;
     cerr << "Usage:" << endl;
     cerr << " testem factorgraph.fg evidence.tab emconfig.em" << endl;
@@ -21,15 +32,14 @@ void usage( const string& msg ) {
 
 int main( int argc, char** argv ) {
     if( argc != 4 )
-      usage("Incorrect number of arguments.");
-    
+        usage("Incorrect number of arguments.");
+
     FactorGraph fg;
-    ifstream fgstream( argv[1] );
-    fgstream >> fg;
+    fg.ReadFromFile( argv[1] );
 
     PropertySet infprops;
-    infprops.Set( "verbose", (size_t)1 );
-    infprops.Set( "updates", string("HUGIN") );
+    infprops.set( "verbose", (size_t)0 );
+    infprops.set( "updates", string("HUGIN") );
     InfAlg* inf = newInfAlg( "JTREE", fg, infprops );
     inf->init();
 
@@ -38,19 +48,22 @@ int main( int argc, char** argv ) {
     e.addEvidenceTabFile( estream, fg );
 
     cout << "Number of samples: " << e.nrSamples() << endl;
-    Evidence::iterator ps = e.begin();
-    for( ; ps != e.end(); ps++ )
-        cout << "Sample " << ps->first << " has " << ps->second.observations().size() << " observations." << endl;
+    for( Evidence::iterator ps = e.begin(); ps != e.end(); ps++ )
+        cout << "Sample #" << (ps - e.begin()) << " has " << ps->size() << " observations." << endl;
 
     ifstream emstream( argv[3] );
     EMAlg em(e, *inf, emstream);
 
     while( !em.hasSatisfiedTermConditions() ) {
         Real l = em.iterate();
-        cout << "Iteration " << em.getCurrentIters() << " likelihood: " << l <<endl;
+        cout << "Iteration " << em.Iterations() << " likelihood: " << l <<endl;
     }
 
-    cout << endl << "Inferred Factor Graph:" << endl << "######################" << endl << inf->fg();
+    cout << endl << "Inferred Factor Graph:" << endl << "######################" << endl;
+    cout.precision(12);
+    cout << inf->fg();
+
+    delete inf;
 
     return 0;
 }