+ fixed a bug in the C++ interface
[qpalma.git] / QPalmaDP / fill_matrix.cpp
index 0c40eee..6104f55 100644 (file)
@@ -69,7 +69,7 @@ int check_char(char base)
 
 void fill_matrix(int nr_paths, Pre_score* matrices[], int est_len /*counter var: i*/, int dna_len /*counter var: j*/, char* est, char* dna, penalty_struct* functions , double* matchmatrix, double* donor, double* acceptor, bool remove_duplicate_scores, int nr_donor_sites, int* donor_sites, int* max_score_positions)
 {      
-  printf("Entering fill_matrix...\n");
+  // printf("Entering fill_matrix...\n");
 
   /*********************************************************************************************/
   // variables
@@ -79,7 +79,7 @@ void fill_matrix(int nr_paths, Pre_score* matrices[], int est_len /*counter var:
   double prevValue ;
   double tempValue;
   int max_len = (int)functions->limits[functions->len-1] ; //last (len) supporting point of h
-  printf("max_len: %d\n", max_len) ;
+  //printf("max_len: %d\n", max_len) ;
 
   int num_elem ; // counter variable
 
@@ -416,7 +416,7 @@ void fill_matrix(int nr_paths, Pre_score* matrices[], int est_len /*counter var:
   delete[] array;
   delete[] scores;
 
-  printf("Leaving fill_matrix...\n");
+  // printf("Leaving fill_matrix...\n");
   return;
 }