+ added configuration file parsing and checking functions
[qpalma.git] / doc / qpalma.tex
index 24799dd..3e0abbb 100644 (file)
@@ -37,10 +37,21 @@ alignment specific options.
 The project results directory (\emph{result\_dir}) contains then the subdirectories
 \begin{itemize}
 \item \emph{mapping} with subdirs main and spliced
-\item \emph{alignment}  with subdirs for the different parameters and \emph{heuristic}
+\item \emph{alignment} with subdirs for the different parameters and \emph{heuristic}
 \item \emph{remapping}
 \end{itemize}
 
+
+Via the variable ``result\_dir'' you can specify where all of QPalma's data should reside.
+This directory contains the following subdirectories:
+\begin{itemize}
+\item preprocessing
+\item approximation
+\item prediction
+\item postprocessing, and 
+\item training
+\end{itemize}
+
 %
 %
 %