+ cleaning up code base
[qpalma.git] / qpalma / Configuration.py
index 7a84d66..e1cb4c7 100644 (file)
@@ -8,7 +8,7 @@ import cPickle
 # choose a path where all results of the QPalma pipeline will be stored
 #
 
-result_dir = '/fml/ag-raetsch/home/fabio/tmp/newest_run'
+result_dir = '/fml/ag-raetsch/home/fabio/tmp/transcriptome_data/prediction'
 
 
 ###############################################################################
@@ -74,7 +74,8 @@ mode = 'using_quality_scores'
 # instead.
 ###############################################################################
 
-read_size = 36
+read_size = 38
+#read_size = 36
 extension = (250,500)
 
 numLengthSuppPoints  = 10