+ fixed matchmatrix for the quality case to be a 1x6 matrix
[qpalma.git] / QPalmaDP /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 637 Makefile
-rw-r--r-- 7349 Mathmatics.cpp
-rw-r--r-- 11236 Mathmatics.h
-rw-r--r-- 1553 QPalmaDP.i
-rw-r--r-- 2783 common.h
-rw-r--r-- 109 config.h
-rw-r--r-- 310 debug_tools.h
-rw-r--r-- 16933 fill_matrix.cpp
-rw-r--r-- 1617 fill_matrix.h
-rw-r--r-- 1514 io.cpp
-rw-r--r-- 592 io.h
-rw-r--r-- 10481 penalty_info.cpp
-rw-r--r-- 994 penalty_info.h
-rw-r--r-- 2485 print_align.cpp
-rw-r--r-- 8053 qpalma_dp.cpp
-rw-r--r-- 3721 qpalma_dp.h
-rw-r--r-- 8114 result_align.cpp