+ fixed matchmatrix for the quality case to be a 1x6 matrix
[qpalma.git] / python /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 9592 Configuration.py
-rw-r--r-- 1722 Plif.py
-rw-r--r-- 4026 SIQP.py
-rw-r--r-- 9448 SIQP_CPX.py
-rw-r--r-- 726 TrainingParam.py
-rw-r--r-- 2554 computeSpliceAlign.py
-rw-r--r-- 3794 computeSpliceAlignWithQuality.py
-rw-r--r-- 3674 computeSpliceWeights.py
-rw-r--r-- 655 compute_donacc.py
-rw-r--r-- 1671 export_param.py
-rw-r--r-- 2276 genome_info.pickle
-rw-r--r-- 101 numpyUtils.py
-rw-r--r-- 4974 paths_load_data.py
-rw-r--r-- 1352 paths_load_data_pickle.py
-rw-r--r-- 2262 paths_load_data_solexa.py
-rw-r--r-- 990 penalty_lookup_new.py
-rw-r--r-- 17563 qpalma.py
-rw-r--r-- 4032 set_param_palma.py