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[qpalma.git] / qpalma /
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-rw-r--r-- 3555 Lookup.py
-rw-r--r-- 8477 OutputFormat.py
-rw-r--r-- 20966 PipelineHeuristic.py
-rw-r--r-- 3512 Plif.py
-rw-r--r-- 6779 SIQP.py
-rw-r--r-- 11908 SIQP_CPX.py
-rw-r--r-- 5923 SIQP_CVXOPT.py
-rw-r--r-- 3185 SettingsParser.py
-rw-r--r-- 726 TrainingParam.py
-rw-r--r-- 13 __init__.py
-rw-r--r-- 8667 computeSpliceAlignWithQuality.py
-rw-r--r-- 4880 computeSpliceWeights.py
-rw-r--r-- 2276 genome_info.pickle
-rw-r--r-- 9106 gridtools.py
-rw-r--r-- 21841 palma_utils.py
-rw-r--r-- 24740 qpalma_main.py
-rw-r--r-- 12642 sequence_utils.py
-rw-r--r-- 3318 set_param_palma.py
drwxr-xr-x - tools
-rw-r--r-- 7378 utils.py